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都是qPCR,结果为何差距这么大?

点击次数:6384   发布时间:2023/3/25 10:43:49

 qPCR技术是分子生物实验中,常见的一种几首手段。使用Quantitative Real Time PCR扩增装置即qPCR仪,通过不同的化学原理和数学原理,在PCR过程中实时监测核酸扩增产物的技术。qPCR实现了通过Ct值和标准曲线的分析对起始模板进行定量分析。

qPCR的荧光标记方法分为以添加荧光基团核酸探针为主的荧光探针法,以绿色染料为主的荧光染料嵌合法。
 

利用不同化学原理设计的qPCR实验,

实验结果可能会产生不小的差距!
 

本期内容,我们一起来聊聊这两种常见的qPCR荧光标记方法有何不同,帮助大家选择更符合自身实验需求的方法。


荧光探针法

简单来说,应用该原理的荧光探针,是由荧光基团+DNA寡核苷酸+淬灭基团构成。

探针由5’端标记有荧光报告基团、目标基因特异性结合的寡核苷酸序列以及3’端标记有淬灭基团以及与组成。

自然状态下,探针完整,荧光报告基团发射的荧光信号被淬灭基团吸收,仪器不会检测到荧光信号。

当存在目标序列时,目标DNA变性解链,荧光探针特异性结合到目标基因处。引物也结合在目标基因上,Taq酶又名DNA聚合酶,能将核苷酸添加到引物中,引物开始延伸。

Taq酶还具有5’-3’核酸外切酶活性。当引物延伸至探针结合处,可将探针水解,使荧光报告基团和淬灭基团分离,进而被qPCR仪检测到荧光信号,荧光信号的强度与扩增得到的DNA的浓度成正比。

荧光信号被仪器检测并采集得到“扩增曲线”,通过荧光信号的强度反映出体系中双链DNA的浓度。

荧光探针有许多不同种类,以应对不同的实验需求,该方法特异性高,已经被广泛地应用于基因检测、病原体和病毒检测、疾病耐药基因筛查等领域。

 

德国MB支原体检测试剂盒

Venor®Gem qEP

应用荧光探针法对支原体DNA进行检测,准确率高,使用方便。

荧光染料嵌合法

该方法用到一种非特异性双链DNA荧光染料,被激发后,显示为绿色荧光。

该染料以一种非特异性方式,与双链DNA(dsDNA)双螺旋小沟区域相结合。游离的染料荧光信号微弱,在进行qPCR扩增生成dsDNA时,染料逐渐与dsDNA结合,荧光信号被很大程度放大,荧光信号的强度与扩增得到的dsDNA的浓度成正比。

荧光信号被仪器检测并采集得到“扩增曲线”,通过荧光信号的强度反映出体系中dsDNA的浓度。

德国MB支原体qPCR检测试剂盒,应用荧光探针法原理,对支原体DNA进行检测,具有特异性更强、灵敏度更高、可重复性更佳的特点。

支原体检测方面,通过欧洲药典和日本药典方法学检验。

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