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支原体标准品在核酸法验证中的应用

点击次数:3197   发布时间:2020/10/14 12:54:25

 支原体核酸法

是通过检测支原体的特异核酸序列,以确定细胞上清或生物制品中是否存在支原体污染的一种方法。由于它具有检测时间短(只需3-4h)、操作便捷等特点,越来越受到生物制品企业的青睐。

支原体核酸法包括PCR和qPCR,可作为药典规定的培养法或DNA染色法的替代方法,或与以上方法相互补充。事实上,早在2011年,就有动物疫苗厂家在2011年第5期的《广东农业科学》上,报道了用德国Minerva Biolabs(简称MB)公司的支原体PCR试剂盒,用于检测疫苗中是否存在支原体的污染,它可与培养法互为补充,共同用于生产,为生产提供可靠的数据支持。

 

但支原体核酸法在用于放行检测之前,需行方法验证。欧洲药典和日本药典均规定了核酸法的灵敏度、特异性和耐用性需要达到的要求。

例如,在灵敏度方面(又称检测限),要求核酸法替代培养法,则灵敏度需达到10CFU/ml;核酸法替代DNA染色法,则灵敏度需达到100CFU/ml。

 

在特异性方面,欧洲药典和日本药典要求,核酸法要识别指定的常见9种支原体,而不识别与支原体有近缘关系的菌属,如丙酮丁醇梭菌、嗜酸乳杆菌和肺炎链球菌,也不识别其他细菌和哺乳动物DNA。

在耐用性方面,欧洲药典要求检测结果不受方法参数的小的偏差的影响,如浓度的变化(MgCl2、引物、dNTP)、提取步骤的细微差别等。实际上这是强调结果的可靠性和稳定性,不受人为操作误差的影响。这可通过3轮不同时间段内的检测来实现,每轮进行8次重复检测,*后观察结果有什么变化。

在进行方法验证时,参比标准品是必不可少的。世界著名微生物防控专家德国MB公司提供有一系列的支原体标准品和支原体DNA标准品,用于支原体核酸法的方法学验证。

 
 
 

图. MB公司提供的10CFU™支原体套装

MB提供的标准品有三类:

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类标准品为【灵敏度标准品】,它同时也用于耐用性验证。该标准品为冻干粉型的灭活支原体,这样不会造成实验室污染。原支原体来自英国NCTC菌种保藏中心,由于传代次数低,也很少发生突变。支原体经标准定量,有10CFU/管和100CFU/管可选。使用时用1ml与待测样本同样的基质液去溶解。之后进行支原体DNA抽提,再进行核酸法检测。如结果阳性,则表明检测限能达到上述标准。

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第二类标准品为【特异性验证用标准品】,它包括支原体基因组DNA以及细菌基因组DNA,种属经测序验证。该标准品为10ng左右包装,为冻干粉型。

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第三类标准品为经过严格定量的

【支原体DNA标准品】,每管支原体基因组DNA的量为1×108基因组拷贝,用于10倍梯度稀释制备标准曲线,以对核酸法(主要是qPCR)的检测限进行精确定量,并可验证标准品浓度对数与Ct值的线性关系。

图. 肺炎支原体DNA的定量。

模板DNA的范围为2X105-2个拷贝数基因组

 

值得指出的是,欧洲药典和日本药典均要求行支原体DNA抽提,再进行核酸法检测。因此,方法验证实际上包括了核酸法的这两部分。

对于生物制品、细胞治疗产品的生产企业,在选用已经过厂家全面验证的支原体检测试剂盒之外,还需自己按照待测样本类型进行方法的适用性验证。因为试剂盒的验证并不能代替包括操作过程在内的方法的适用性,操作、样本基质和仪器同样会对核酸法的技术指标产生不可忽视的影响。

原创作者:北京缔一生物科技有限公司

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